Обычно заполнение аквариума водой происходит после посадки растений. Сделать это несложно, но помните: нельзя взмучивать грунт. Лучше всего на дно положить кусок фанеры, лист бумаги или блюдце дном вверх. Емкость с водой, предназначенной для заполнения аквариума, ставится на подставку выше аквариума. Один конец шланга опускается в эту емкость, через другой конец ртом подсасывают воду и направляют струю таким образом, чтобы она сливалась на подставленные фанеру, лист бумаги или дно блюдца. При этом желательно загнуть конец шланга кверху, чтобы вода падала набольшим фонтанчиком.

После наполнения аквариума водой его закрывают покровным стеклом и оставляют на несколько дней без рыб. В это время здесь устанавливается биологическое равновесие. Этот процесс заключается в обильном размножении микроорганизмов, последовательно сменяющих друг друга. Внешне это проявляется в виде помутнения воды. Через несколько дней муть исчезает, вода становится прозрачной, и в нее можно заселять рыб. Этот процесс можно ускорить, добавив воды из аквариума, где уже установилось биологическое равновесие.