дорогие аквариумисты! с 1.12.2011 сайт aquaria2.ru превращен в памятник.
на нем закрыта регистрация, создание новых материалов и комментариев.
активная версия аквариумного сайта теперь доступна по адресу http://aquaria.ru.
все материалы и регистрации пользователей aquaria2, созданные до 29.11.2011, блоги, темы форума, комментарии перенесены на новый сайт.
...нельзя быть современным биологом
не зная генетики
С.Г. Инге-Вечтомов
...журнал «Генетика гуппи»... какое многообещающее название... и целевая аудитория, вроде бы, подходящая... и автор, вроде бы, кандидат биологических наук и цитолог... вроде бы, увлекается гуппи... вроде бы, имеет опыт ведения научных исследований и преподавания... вроде бы, имеет навык написания статей, в т.ч. научных...
Напомню, что автор себя позиционирует следующим образом:
Сергель :
...В 2000 году окончил биологический факультет (кафедра клеточной физиологии и иммунологии, сейчас — кафедра физиологии микроорганизмов) по специальности микробиология (специализация — иммунология).
Кандидат биологических наук по специальности «Аллергология и иммуноогия».
Старший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии Московского НИИ медицинской экологии, преподаватель кафедры биохимии Московской медицинской академии им. И.М. Сеченова (1-й Мед) с 2005 по 2008 гг.
С 1998 года по 2004 год занимался разработкой диагностических тест-систем и первой отечественной вакциной против ВИЧ/СПИДа (сейчас вакцина проходит клинические испытания).
В настоящее время занимаюсь исследованием генетических маркеров для дифференциальной диагностики доброкачественных и злокачественных новообразований предстательной железы (рак простаты, аденома и т.д.).
Более 40 научных и научно-популярных статей в отечественых и зарубежных журналах и другой печатной периодике (в том числе “Aquarium magazine”, «Аквариум», «Современный аквариум», «Рыбалка на Руси», «На рыбалку», «Иммунология», «Генетика», «Стоматология Today» и др.), 1 методическое пособие и 1 патент РФ.
свое «издание» таким:
Т.е., как минимум, можно было предположить, что нам, неофитам, расскажут понятным языком, «что, как и почему» нужно делать, объяснят непонятное... Что же мы получили в итоге? Замечания:
1. Я, по специальности, не биолог.
2. Образование — высшее.
3. Иностранными языками — не владею.
4. Читать и пользоваться литературой — умею.
5. Орфография приводимых цитат сохранена.
6. Имеющийся объём знаний позволяет оценить данное «издание» безличностно.
7. Обижаться на данное письмо — глупо, ибо — на правду не обижаются.
8. Всем желающим принять участие в дискуссии рекомендую почитать соответствующие материалы, например:
Крестьянинов Ю.В., Вайнер Г.В. Сборник задач по генетике с решениями: Методическое пособие. — Саратов: «Лицей», Б.г. [он-лайн версия]
Лобашев М.Е. Генетика: Учебное пособие. — Л.: Изд-во Ленинградского ун-та. 1969. — 752 с.
Медведев Н.Н. Практическая генетика. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Наука, 1968. — 294 с.
Прочла первый номер — промолчала... другие — высказались:
euggn :
Журнал почитал он-лайн.
Впечатления — двойственные.
С одной стороны — земной поклон за перевод и вклад в популяризацию...
С другой — пожелание покорректнее компилировать и соблюдать общепринятые нормы в части авторских прав
и
euggn :
когда взрослый, как любит говорить Слава — половозрелый человек, с неплохим образованием берет чужой материал (допустим, малоизвестный, широким кругам аквариумистов в России, потому что он, скажем, в оригинале — на другом языке) — он, вообще-то не должен, на радостях от великой находки, лепить его под своей фамилией и защищать, типа копирайтом (насчет ссылок и разрешений). Отчасти потому, что сам «ссылками и разрешениями» вообще не парился, а главным образом — потому, что у пишущих людей есть правила на сей счет: материал целиком — с разрешения, как перевод, выдержки — цитатой или сноской, компилляцию по источникам — с библиографией.
А иначе это называется — «воровство».
Мне же, журнал напомнил вот это:
один из вариантов известного анекдота :
— Папа, а почему, когда яблоко откусишь, оно делается коричневым?
— Дело в том, сынок, что в яблоке имеются различные химические вещества. Одно из них — железо. Так вот, когда железо вступает с кислородом, находящимся в воздухе, в химическую реакцию, получается окисление. В результате образуется вещество, которое и окрашивает яблоко в коричневый цвет.
— Папа, а с кем ты сейчас разговаривал?
замечу, что правильный ответ на заданный в анекдоте вопрос звучит так:
torontonian :
Как-то случайно выяснил, что некоторые действительно верят в это. Хотелось бы развеять заблуждение.
Яблоки темнеют совсем не от того, что в них якобы окисляется железо! Мякоть яблок темнеет из-за окисления танинов и других фенольных соединений на воздухе.[выделено — мной, О-Л]
Прочтение второго номера лишь подтвердило сложившееся мнение.
Так, что же «не так» в рассматриваемом «журнале»?
Откроем, например, учебное пособие Тихомирова М.М. Генетический анализ. — Л.: Изд-во ЛГУ, 1990. — 280 с.
и сравним то, чему учат биологов в вузе, с «трудами» авторов
Предупреждение: Сергей, прошу не взваливать свои огрехи на Сторожева, вы — кандидат биологических наук [и прочая, и прочая...], В.В. — нет.
«Научная» компонента «издания» — ваша. И, к огромному сожалению, она не соответствует даже уровню первокурсника... Увы... Постскриптум(добавлено 21.01.2010)
Факты таковы:
1. Обсуждения по СУЩЕСТВУ не получилось. И не только из-за того, что многим не понравилось моё решение публично озвучить эти вопросы. То, что авторам НЕЧЕГО ответить по СУЩЕСТВУ — очевидно. Переход на оскорбления это подтверждает.
2. Приношу свои извинения посетителям Aquaria2.RU, вынужденным читать грубости написанные некоторыми из участников этого обсуждения.
3. Если бы я знала раньше, что для одного из авторов главная проблема
hiv, 09.07.2008, 02:22 :
...Опять приходится сделать самое тяжеле в жизни - думать
то тему назвала бы не «Открытое письмо Сергею Апрятину», а «рецензия»...
В общем, я своё мнение высказала, проблему обозначила, аргументы привела — решать каждому САМОМУ.
Не имеющие отношения к проблеме мысли озвучить можно там
Добавлено 16.06.2010 Мнение Филипа Шеддока по поводу таблицы Сторожева-Апрятина можно прочитать на английском языке или воспользоваться автоматическим переводчиком, например от
2. Методика изложения материала
Ещё раз напомню, рассматриваемое «издание» адресовано не специалистам-генетикам, а обычным аквариумистам-любителям, т.е. априори, имеющих, максимум, биологическое образование в рамках средней общеобразовательной школы, да и то, не всегда, «на отлично». Следовательно, изложение материала предполагается адаптированным для данной читательской аудитории... Но адаптация, это не значит перевирание и манипулирование смыслом излагаемого материала.
В данном случае, адаптация, — это изложение материала словами, понятными читателю, без излишнего употребления специальной терминологии.
Мы же читаем:
Апрятин С.А. Основные понятия и термины общей генетики (часть 1) :
Генотип — вся генетическая информация организма.
Угу — «масло — маслянная субстанция» — очень «информативно»
Можно было написать, например так: «Генотип — совокупность всех наследственных факторов организма».
Напомню: при полном доминировании гетерозиготная особь выглядит также, как и гомозиготная доминанта, хотя генотип у них РАЗЛИЧЕН. Заметьте, в одинаковых условиях. Автор же нам рассказывает:
Апрятин С.А. Основные понятия и термины общей генетики (часть 1) :
Фенотип — внешнее проявление свойств организма (размер,
форма, цвет, плодовитость и т.п.), зависящих от его генотипа и
факторов окружающей среды.
Интересно, автор знаком с термином «Фенокопия»? Если «да», то КАК он его трактует?
Равич-Щербо. В. Психогенетика :
Понятия «генотип» и «фенотип» интимным образом связаны с понятиями «наследственность» и «среда», но не идентичны им. Эти понятия ввел В. Иоганнсен в 1909 г. Понятием «генотип» обозначается сумма всех генов организма, наследственная конституция организма, совокупность всех наследственных задатков данной клетки или организма, т.е. набор генов, состоящих из молекул дезоксирибонуклеино-вой кислоты (ДНК) и организованных в хромосомный ряд. Генотип организма является результатом слияния двух гамет (яйцеклетки и оплодотворяющего ее спермия). Понятием «фенотип» обозначаются любые проявления живущего организма — его морфологические, физиологические, психологические и поведенческие особенности. Фенотипы не наследуются, а формируются в течение жизни; они — продукт чрезвычайно сложного взаимодействия генотипа и среды.
Важно отметить, что существуют единичные признаки, фенотип которых полностью определяется их генетическими механизмами. Примеры таких признаков — полидактилия (наличие добавочного пальца) или группа крови человека. Однако подобных признаков совсем немного, и за очень редким исключением фенотип признака определяется совместным влиянием генотипа и среды, в которой этот генотип существует.
Для любого генотипа существует диапазон сред, в котором он может проявить себя «максимально»; среду, одинаково благоприятную для всех генотипов, найти нельзя. Дело не в обогащенности сред, а в их качественном разнообразии. Сред должно быть много, чтобы у каждого генотипа была возможность найти «свою» среду и реализоваться. Однообразная среда, какой бы обогащенной она ни была, будет благоприятствовать развитию только определенных, а не всех генотипов.
По мнению автора
на самом же деле
смысл совершенно другой.
Замечу, что «вырванное» автором из контекста «определение термина»
БСЭ :
Поглотительное скрещивание, преобразовательное скрещивание, один из видов скрещивания, применяемый для коренного улучшения малопродуктивных пород высокопродуктивными. Простое Поглотительное скрещивание заключается в спаривании животных двух пород (улучшаемой и улучшающей) для получения помесей, которых затем в ряде поколений спаривают с производителями улучшающей породы до получения животных желательного типа. Высокопродуктивных помесей 4—5—6-го поколений (высококровных), отвечающих типу улучшающей породы, разводят «в себе» (см. Разведение «в себе»), что иногда заканчивается созданием новой породы. [Выделено мной. О-Л] Поглотительное скрещивание, в котором участвуют несколько улучшающих пород, называемых сложным. Поглотительное скрещивание — наиболее быстрый и эффективный способ массового улучшения малопродуктивного скота, а также преобразования пород с.-х. животных (например, грубошёрстных пород овец в тонкорунных и полутонкорунных). Скорость преобразования и улучшения пород зависит от степени наследственных различий между животными скрещиваемых пород, степени наследственной устойчивости (консолидации) пород, тщательности отбора и подбора среди помесей, а также условий кормления и содержания помесного молодняка. Поглотительное скрещивание применяется при разведении почти всех видов с.-х. животных. В СССР оно особенно широко использовалось в 1925—50 для повышения породности и продуктивности товарных и племенных стад.
и интерпретированное в меру своего разумения, демонстрирует непонимание автором «объясняемого» процесса и его роль, как в генетическом анализе, так и в селекционной работе.
«Высокоселекционные» фантазии автора — фантазиями и останутся. Селекция не бывает ни «высокой», ни «низкой»... Селекция либо проводится, либо — нет. Также, как и порода: либо она есть, либо — нет. Если породой не заниматься, то она может быть утеряна.
Википедия :
Порода — совокупность домашних животных одного вида, искусственно созданная человеком и характеризующаяся определенными наследственно закрепленными особенностями.
По мнению автора
на самом же деле
БСЭ :
Реципрокное скрещивание, система из двух скрещиваний — прямого и обратного. При Р. с. каждый из генотипически различных родительских типов А и В используется дважды — один раз в качестве материнской и другой раз в качестве отцовской форм (♀А×♂В и ♀В×♂А).
Для чего же нужны реципрокные скрещивания? Р.с. выявляют, зависит ли анализируемый признак от того, кто из родителей — мать или отец — передал потомству ген, определяющий этот признак или такая зависимость отсутствует.
Аналогичные огрехи можно увидеть практически по каждому авторскому пояснению понятий и терминов, включенных автором в «Основные понятия...»
1. Общее замечание
Полное отсутствие цитат и ссылок на первоисточники предполагает, что рассматриваемые вопросы плод исключительно авторского труда, так сказать, инновация — как же, автором создана новая наука — генетика в целом и генетика гуппи, в частности:
Владимир Сторожев и Сергей Апрятин :
...Тематика журнала узко специфична и не имеет аналогов, как в нашей стране, так и в мире...
Замечу, что существует некоторое количество ДОСТУПНЫХ для свободного ознакомления публикаций именно по рассматриваемой «узкоспецифичной» теме [вообще-то, «это» называется «частная генетика»] — «генетика гуппи», в т.ч. и научных, на иностранных языках, в первую очередь — на английском, в т.ч. и выложенных онлайн, для других, закрытых для свободного бесплатного доступа, бывают доступны аннотации работ.
Т.е. автор, по меньшей мере, дезинформирует читателя. (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ...)
Принципы составления автором «Основных понятий и терминов общей генетики» и очерёдности их размещения в выпусках полностью лишены какой-либо логики: большинство упоминаемых в конкретном выпуске терминов не используется, в тоже время в текстах статей встречаются специальные термины, почему-то, без каких-либо пояснений...
Формулировки же приведённых в «издании» понятий и терминов... щедро «украшенных» упомянутыми не к месту другими понятиями и терминами целиком на совести авторской фантазии. Увы...
Полное отсутствие общепринятых в генетике записей, схем, таблиц, описаний, гипотез, расчётов и т.д., а также адекватных пояснений к ним позволяет усомниться в ценности рассматриваемого «издания» для любых из заявленных автором целей.
Т.е. данное «издание» ничему путному научить не может. Это, больше похоже на неудачный рекламный проспект: картинки — красочны, текст — невнятен... и они взаимно не связаны.
Вывод, увы, таков: к огромному сожалению, ни в одном из выпусков «издания» заявленная тема не раскрыта «ни на йоту».
2. Методика изложения материала
Ещё раз напомню, рассматриваемое «издание» адресовано не специалистам-генетикам, а обычным аквариумистам-любителям, т.е. априори, имеющих, максимум, биологическое образование в рамках средней общеобразовательной школы, да и то, не всегда, «на отлично». Следовательно, изложение материала предполагается адаптированным для данной читательской аудитории... Но адаптация, это не значит перевирание и манипулирование смыслом излагаемого материала.
В данном случае, адаптация, — это изложение материала словами, понятными читателю, без излишнего употребления специальной терминологии.
Мы же читаем:
Генотип — вся генетическая информация организма.
Угу — «масло — маслянная субстанция» — очень «информативно»
Можно было написать, например так: «Генотип — совокупность всех наследственных факторов организма».
Напомню: при полном доминировании гетерозиготная особь выглядит также, как и гомозиготная доминанта, хотя генотип у них РАЗЛИЧЕН. Заметьте, в одинаковых условиях. Автор же нам рассказывает:
Фенотип — внешнее проявление свойств организма (размер,
форма, цвет, плодовитость и т.п.), зависящих от его генотипа и
факторов окружающей среды.
Интересно, автор знаком с термином «Фенокопия»? Если «да», то КАК он его трактует?
Понятия «генотип» и «фенотип» интимным образом связаны с понятиями «наследственность» и «среда», но не идентичны им. Эти понятия ввел В. Иоганнсен в 1909 г. Понятием «генотип» обозначается сумма всех генов организма, наследственная конституция организма, совокупность всех наследственных задатков данной клетки или организма, т.е. набор генов, состоящих из молекул дезоксирибонуклеино-вой кислоты (ДНК) и организованных в хромосомный ряд. Генотип организма является результатом слияния двух гамет (яйцеклетки и оплодотворяющего ее спермия). Понятием «фенотип» обозначаются любые проявления живущего организма — его морфологические, физиологические, психологические и поведенческие особенности. Фенотипы не наследуются, а формируются в течение жизни; они — продукт чрезвычайно сложного взаимодействия генотипа и среды.
Важно отметить, что существуют единичные признаки, фенотип которых полностью определяется их генетическими механизмами. Примеры таких признаков — полидактилия (наличие добавочного пальца) или группа крови человека. Однако подобных признаков совсем немного, и за очень редким исключением фенотип признака определяется совместным влиянием генотипа и среды, в которой этот генотип существует.
Для любого генотипа существует диапазон сред, в котором он может проявить себя «максимально»; среду, одинаково благоприятную для всех генотипов, найти нельзя. Дело не в обогащенности сред, а в их качественном разнообразии. Сред должно быть много, чтобы у каждого генотипа была возможность найти «свою» среду и реализоваться. Однообразная среда, какой бы обогащенной она ни была, будет благоприятствовать развитию только определенных, а не всех генотипов.
По мнению автора
на самом же деле
смысл совершенно другой.
Замечу, что «вырванное» автором из контекста «определение термина»
Поглотительное скрещивание, преобразовательное скрещивание, один из видов скрещивания, применяемый для коренного улучшения малопродуктивных пород высокопродуктивными. Простое Поглотительное скрещивание заключается в спаривании животных двух пород (улучшаемой и улучшающей) для получения помесей, которых затем в ряде поколений спаривают с производителями улучшающей породы до получения животных желательного типа. Высокопродуктивных помесей 4—5—6-го поколений (высококровных), отвечающих типу улучшающей породы, разводят «в себе» (см. Разведение «в себе»), что иногда заканчивается созданием новой породы. [Выделено мной. О-Л] Поглотительное скрещивание, в котором участвуют несколько улучшающих пород, называемых сложным. Поглотительное скрещивание — наиболее быстрый и эффективный способ массового улучшения малопродуктивного скота, а также преобразования пород с.-х. животных (например, грубошёрстных пород овец в тонкорунных и полутонкорунных). Скорость преобразования и улучшения пород зависит от степени наследственных различий между животными скрещиваемых пород, степени наследственной устойчивости (консолидации) пород, тщательности отбора и подбора среди помесей, а также условий кормления и содержания помесного молодняка. Поглотительное скрещивание применяется при разведении почти всех видов с.-х. животных. В СССР оно особенно широко использовалось в 1925—50 для повышения породности и продуктивности товарных и племенных стад.
и интерпретированное в меру своего разумения, демонстрирует непонимание автором «объясняемого» процесса и его роль, как в генетическом анализе, так и в селекционной работе.
«Высокоселекционные» фантазии автора — фантазиями и останутся. Селекция не бывает ни «высокой», ни «низкой»... Селекция либо проводится, либо — нет. Также, как и порода: либо она есть, либо — нет. Если породой не заниматься, то она может быть утеряна.
Порода — совокупность домашних животных одного вида, искусственно созданная человеком и характеризующаяся определенными наследственно закрепленными особенностями.
По мнению автора
на самом же деле
Реципрокное скрещивание, система из двух скрещиваний — прямого и обратного. При Р. с. каждый из генотипически различных родительских типов А и В используется дважды — один раз в качестве материнской и другой раз в качестве отцовской форм (♀А×♂В и ♀В×♂А).
Для чего же нужны реципрокные скрещивания? Р.с. выявляют, зависит ли анализируемый признак от того, кто из родителей — мать или отец — передал потомству ген, определяющий этот признак или такая зависимость отсутствует.
Аналогичные огрехи можно увидеть практически по каждому авторскому пояснению понятий и терминов, включенных автором в «Основные понятия...»
1. Общее замечание
Полное отсутствие цитат и ссылок на первоисточники предполагает, что рассматриваемые вопросы плод исключительно авторского труда, так сказать, инновация — как же, автором создана новая наука — генетика в целом и генетика гуппи, в частности:
...Тематика журнала узко специфична и не имеет аналогов, как в нашей стране, так и в мире...
Замечу, что существует некоторое количество ДОСТУПНЫХ для свободного ознакомления публикаций именно по рассматриваемой «узкоспецифичной» теме [вообще-то, «это» называется «частная генетика»] — «генетика гуппи», в т.ч. и научных, на иностранных языках, в первую очередь — на английском, в т.ч. и выложенных онлайн, для других, закрытых для свободного бесплатного доступа, бывают доступны аннотации работ.1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 ...)
Т.е. автор, по меньшей мере, дезинформирует читателя. (
Принципы составления автором «Основных понятий и терминов общей генетики» и очерёдности их размещения в выпусках полностью лишены какой-либо логики: большинство упоминаемых в конкретном выпуске терминов не используется, в тоже время в текстах статей встречаются специальные термины, почему-то, без каких-либо пояснений...
Формулировки же приведённых в «издании» понятий и терминов... щедро «украшенных» упомянутыми не к месту другими понятиями и терминами целиком на совести авторской фантазии. Увы...
Полное отсутствие общепринятых в генетике записей, схем, таблиц, описаний, гипотез, расчётов и т.д., а также адекватных пояснений к ним позволяет усомниться в ценности рассматриваемого «издания» для любых из заявленных автором целей.
Т.е. данное «издание» ничему путному научить не может. Это, больше похоже на неудачный рекламный проспект: картинки — красочны, текст — невнятен... и они взаимно не связаны.
Вывод, увы, таков: к огромному сожалению, ни в одном из выпусков «издания» заявленная тема не раскрыта «ни на йоту».